| Rektor | rektor | prof. Ing. Ferdinand Daňo, PhD. |
| Sekretariát rektora | vedúca | Ing. Kamila Nemcová |
| asistentka rektora | Mgr. Martina Prejsová | |
| Kvestorka | kvestorka | Ing. Mária Dziurová |
| Sekretariát kvestorky | sekretárka | Mgr. Viera Gablíková |
| Oddelenie pre plán a rozpočet | vedúca | Ing. Marta Trunkvalterová |
| Oddelenie finančnej učtárne | vedúca | Ing. Iveta Mattovičová |
| Oddelenie prevádzky a investícií | vedúca | Ing. Jozef Cerovský |
| Oddelenie ekonomiky práce a mzdovej učtárne | vedúca | Ing. Danica Svobodová |
| Oddelenie pre verejné obstarávanie | vedúca | Ing. Anna Národová |
| Právny referát | ||
| Útvary podliehajúce priamo rektorovi | ||
| Centrum podnikateľských činností a univerzitných služieb | riaditeľka | Ing. Helena Kuchyňková |
| Centrum komunikácie a vzťahov s verejnosťou | vedúci | Ing. Miroslav Horňák |
| Oddelenie pre personálne a sociálne otázky | vedúca | RNDr. Daniela Lukáčová |
| Referát civilnej ochrany | referent | JUDr. Pavel Adamik |
| Referát kontroly | ||
| Referát BOZPaPO | referent | Ing. Ladislav Kozák |
| ARCHÍV | riaditeľka | Mgr. Eva Kočiová |
| Centrum protidrogových a poradenských služieb | koordinátor | prof. Ing. Rudolf Šlosár, PhD. |
| Prorektor pre vzdelávanie | doc. Mgr. Ing. Zuzana Juhászová, PhD. | |
| Pedagogické oddelenie | Mgr. Alexandra Jurkovičová | |
| Centrum telesnej výchovy a športu | riaditeľ | PaedDr. Július Dubovský |
| Prorektor pre rozvoj univerzity | Dr.h.c. prof. Ing. Rudolf Sivák, PhD. | |
| Organizačný referát | Mgr. Zuzana Pupáková | |
| Centrum informačných technológií | riaditeľ | Ing. Martin Novák |
| Výskumno-vzdelávacie a informačné centrum bioenergie (Kapušany) | riaditeľ | Mgr. Ján Sarvaš |
| Prorektor pre vedu a doktorandské štúdium | Ing. Paula Puškárová, DiS. art., Ph. D. | |
| Oddelenie pre vedu a doktorandské štúdium | ||
| Ústav ekonómie a manažmentu | vedúci | prof. Ing. Peter Staněk, PhD. |
| Národné centrum európskych a globálných štúdií | ||
| Ekonomické rozhľady | výkonný redaktor | doc. Ing. Ladislav Pupala, CSc. |
| Prorektor pre medzinárodné vzťahy, štatutárny zástupca rektora | doc. Mgr. Boris Mattoš, PhD. | |
| Centrum medzinárodných vzťahov | ||
| Prorektor pre manažovanie akademických projektov | doc. Ing. Jana Péliová, PhD. | |
| Bratislavská Business School | Ing. Milan Staňo | |
| Slovenská ekonomická knižnica | riaditeľka | Mgr. Jitka Kmeťová |
| Centrum na zabezpečenie a podporu kvality | ||
| Dekan Národohospodárskej fakulty | prof. Ing. Erika Pastoráková, PhD. | |
| Dekan Obchodnej fakulty | Ing. Peter Drábik, PhD. | |
| Dekan Fakulty hospodárskej informatiky | prof. Ing. Ivan Brezina, CSc. | |
| Dekan Fakulty podnikového manažmentu | prof. Ing. Peter Markovič, PhD. | |
| Dekan Fakulty medzinárodných vzťahov | PhDr. Rudolf Kucharčík, PhD. | |
| Dekan Fakulty aplikovaných jazykov | doc. PhDr. Radoslav Štefančík, MPol. PhD. | |
| Dekan Podnikovohospodárskej fakulty v Košiciach | Dr.h.c. prof. RNDr. Michal Tkáč, CSc. |