Kolégium rektora EU v Bratislave je stálym poradným orgánom rektora. Členmi kolégia rektora sú: rektor, prorektori, dekani, kvestor, predseda AS EU v Bratislave, zástupca odborov, zástupca študentského parlamentu a ďalší podľa rozhodnutia rektora.
Členovia kolégia rektora
DAŇO, Ferdinand, prof. Ing., PhD., rektor
JUHÁSZOVÁ, Zuzana, doc. Mgr. Ing., PhD., prorektorka pre vzdelávanie
PÉLIOVÁ, Jana, doc. Ing., PhD., prorektorka pre manažovanie akademických projektov
MATTOŠ, Boris, doc. Mgr., PhD., prorektor pre medzinárodné vzťahy
SIVÁK, Rudolf, Dr. h. c. prof. Ing., PhD., prorektor pre rozvoj
PUŠKÁROVÁ, Paula, Ing., DiS. art., PhD., prorektorka pre vedu a doktorandské štúdium
PASTORÁKOVÁ, Erika, prof. Ing., PhD., dekanka Národohospodárskej fakulty
DRÁBIK, Peter, Ing., PhD., dekan Obchodnej fakulty
BREZINA, Ivan, prof. Ing., CSc., dekan Fakulty hospodárskej informatiky
MARKOVIČ, Peter, prof. Ing., PhD., dekan Fakulty podnikového manažmentu
KUCHARČÍK, Rudolf, PhDr., PhD., dekan Fakulty medzinárodných vzťahov
ŠTEFANČÍK, Radoslav, doc. PhDr., MPol., PhD., dekan Fakulty aplikovaných jazykov
TKÁČ, Michal, Dr. h. c. prof. RNDr., CSc., dekan Podnikovohospodárskej fakulty so sídlom v Košiciach
DZIUROVÁ, Mária, Ing., kvestorka
SZAKALOVÁ, Zora, Ing., predsedníčka Rady ZO OZ PŠaV
MAJDÚCHOVÁ, Helena, prof. Ing., CSc., predsedníčka Akademického senátu EU v Bratislave
MAZÁN, Tomáš, prezident Študentského parlamentu